藥師佛加持藥物治病法
南無藥師琉璃光如來
周遍法界，三世常傳，大日如來，亦名釋迦。
妙法教主，憶念本願，像法轉時，以大方便，稱號藥師。
歸命滿月界 淨妙琉璃尊 法藥救人天 因中十二願
慈悲弘誓廣 願度諸含生 我今申讚揚 志心頭面禮
《藥師佛加持藥物治病法 》
(修此法以七日、二十一日、或四十九日為一期，每日修法一至三次。如專修此法以為常課，則功效更大)
南無藥師琉璃光如來(三稱)
南無日光遍照菩薩(三稱)
南無月光遍照菩薩(三稱)
南無十二藥叉大將(三稱)
祈請文：
弟子○○○至誠祈求大慈大悲藥師琉璃光如來及藥師海會諸大聖眾，不違本誓，憐憫有情，加持此藥 (或食物或純水或病人◎◎◎)令病人◎◎◎及法界一切有情眾生，病苦消除，身心健康，壽命延長。
十二神將饒益有情結願神咒(四十九遍)
{若有受持此咒，能滅身中過去生死一切重罪，不復逕歷三途遠離九橫，超越眾苦，十方世界隨處安樂自在無礙，諸有願求，悉令滿足。}
拿摩喇的拿的喇牙呀
拿摩 枯毗喇 趴匝喇 美卡喇 安底喇 嗎底喇 珊底喇
因達喇 巴牙喇 嗎虎喇 親達喇 收杜喇 毗卡喇
拿摩 拔嘎乏得 排曬及牙 骨魯 懷都裡牙 玻喇拔 喇加牙
打他嘎打牙 而哈得 三彌牙割三菩達牙 打笛牙他
嗡 排曬及也 排曬及也 排曬及牙 三母的嘎得 司乏哈
na mo ra tna tra ya ya
na mo ku vi ra pa ca ra me ka ra a ndi ra ma di ra sam ti ra
i nda ra bha ya ra ma hu ra ci nda ra so tu ra vi ka ra
na mo bha ga va te bhai sa jya gu ru vai du lya pra bha ra ja ya
ta tha ga ta ya rha te sa mya ksam bu ddha ya ta dya tha
om bhai sa jye bhai sa jye bhai sa jra sa mu dga te sva ha
藥師心咒：(一○八○遍)
嗡 排曬及也 排曬及也 排曬及牙 三母的嘎得 司乏哈
om bhai sa jye bhai sa jye bhai sa jra sa mu dga te sva ha
唵 鞞殺逝 鞞殺逝 鞞殺社 三沒揭帝 莎訶
回向：願以此功德，回向消災弟子◎◎◎及法界一切有情眾生，業障消除，福慧增長，病苦消除，身心健康，壽命延長。
藥師如來祈願修持儀軌
一、禮敬諸佛
南無常住十方佛 南無常住十方法 南無常住十方僧(各一拜)
南無本師釋迦牟尼佛(一拜)
南無藥師琉璃光如來(三拜)
南無藥師海會諸大聖眾(一拜)
二、稱讚如來
(禮敬既畢，於佛前長跪合掌，稱讚偈云：)
歸命滿月界 淨妙琉璃尊 法藥救人天 因中十二願
慈悲弘誓廣 願度諸含生 我今申讚揚 志心頭面禮
三、廣修供養
(稱讚既畢，於佛前長跪合掌，稱供養偈云：)
願此香花雲 遍滿十方界
一一諸佛土 無量香莊嚴
具足菩薩道 成就如來香
至誠供養大慈大悲藥師琉璃光如來及藥師海會諸大聖眾
嗡 啊摩嘎 補迦 嘛尼 叭德嘛 乏及哩 打他嘎打
維羅ㄍㄧㄉㄝ 三蠻打 缽喇灑喇 吽 (三遍)
嗡 嘎嘎拿 三叭乏 乏及拉 吽 (三遍)
嗡 啊 吽 (三遍)
四、懺悔業障
往昔所造諸惡業 皆由無始貪瞋癡
從身語意之所生 一切我今皆懺悔 (三遍三拜)
嗡 灑爾乏 爸叭 達哈拿 乏及喇牙 司乏哈 (三遍)
五、誦經
誦經之時，跪、立、靜坐均可。
六、持名
藥師如來琉璃光 燄網莊嚴無等倫
無邊行願利有情 各遂所求皆不退
南無東方淨琉璃世界 大慈大悲藥師琉璃光如來
南無藥師琉璃光如來 (一０八遍)
南無日光遍照菩薩 (三遍)
南無月光遍照菩薩 (三遍)
南無十二藥叉大將 (三遍)
七、持咒(藥師灌頂真言四十九遍或一０八遍)
藥師灌頂真言 :
南謨薄伽伐帝 鞞殺社窶嚕 薜琉璃缽喇婆曷囉闍也
呾他揭多也 阿囉喝帝 三藐三勃陀也
呾姪他
唵 鞞殺逝 鞞殺逝 鞞殺社 三沒揭帝 莎訶
八、回向發願
祈求大慈大悲藥師琉璃光如來、及藥師海會諸大聖眾、不違本誓憐憫有情慈悲加被，令……
嗡 司嘛喇 司嘛喇 維嘛拿 灑喇 嘛哈 佳割喇乏 吽 (三遍)
《藥師琉璃光如來十二大願》
佛告曼殊室利：東方去此過十殑伽沙等佛土，有世界名－－淨琉璃，佛號－－藥師琉璃光如來、應、正等覺、明行圓滿、善逝、世間解、無上士、調御丈夫、天人師、佛、薄伽梵。曼殊室利！彼世尊藥師琉璃光如來本行菩薩道時，發十二大願，令諸有情所求皆得。
第一大願：願我來世得阿耨多羅三藐三菩提時，自身光明熾然，照曜無量無數無邊世界，以三十二大丈夫相八十隨好，莊嚴其身，令一切有情如我無異。
[法：同佛相好生佛平等]
第二大願：願我來世得菩提時，身如琉璃，內外明徹，淨無瑕穢，光明廣大，功德巍巍，身善安住，焰網莊嚴，過於日月，幽冥眾生悉蒙開曉，隨意所趣，作諸事業。
[報：身光利他開曉事業]
第三大願：願我來世得菩提時，以無量無邊智慧方便，令諸有情皆得無盡所受用物，莫令眾生有所乏少。
[應：受用智便無盡資生]
第四大願：願我來世得菩提時，若諸有情行邪道者，悉令安住菩提道中；若行聲聞、獨覺乘者，皆以大乘而安
立之。
[慧：安住大乘]
第五大願，願我來世得菩提時，若有無量無邊有情，於我法中修行梵行，一切皆令得不缺戒，具三聚戒。設有毀犯，聞我名已，還得清淨，不墮惡趣。
[戒：戒行清靜]
第六大願：願我來世得菩提時，若諸有情其身下劣，諸根不具，醜陋頑愚，盲聾瘖啞，攣躄背僂，白癩癲狂，種種病苦，聞我名已，一切皆得端正黠慧，諸根完具，無諸疾苦。
[定：諸根端嚴]
第七大願：願我來世得菩提時，若諸有情眾病逼切，無救無歸，無醫無藥，無親無家，貧窮多苦，我之名號一經其耳，眾病悉除，身心安樂，家屬資具悉皆豐足，乃至證得無上菩提。
[眾：除病離貧眷屬增益]
第八大願：願我來世得菩提時，若有女人為女百惡之所逼惱，極生厭離，願捨女身，聞我名已，一切皆得轉女成男，具丈夫相，乃至證得無上菩提。
[主：轉女成男具丈夫相]
第九大願：願我來世得菩提時，令諸有情出魔羂網，解脫一切外道纏縛，若墮種種惡見稠林，皆當引攝置於正見，漸令修習諸菩薩行，速證無上正等菩提。
[行：魔外歸正速證菩提]
第十大願：願我來世得菩提時，若諸有情王法所繩，縛錄鞭撻，繫閉牢獄，或當刑戮，及餘無量災難淩辱，悲愁煎迫，身心受苦，若聞我名，以我福德威神力故，皆得解脫一切憂苦。
[願：免難消災解脫憂苦]
第十一大願：願我來世得菩提時，若諸有情飢渴所惱，為求食故，造諸惡業，得聞我名，專念受持，我當先以上妙飲食飽足其身，後以法味畢竟安樂而建立之。
[功：得妙飲食法味勝樂]
第十二大願：願我來世得菩提時，若諸有情貧無衣服，蚊蝱寒熱晝夜逼惱，若聞我名，專念受持，如其所好，即得種種上妙衣服，亦得一切寶莊嚴具，華鬘塗香，鼓樂眾伎，隨心所翫，皆令滿足。
[果：得妙衣具度生無盡]
曼殊室利！是為彼世尊藥師琉璃光如來、應、正等覺行菩薩道時，所發十二微妙上願。
南無藥師琉璃光如來
法門寺地宮第四重寶函 唐密藥師琉璃光如來曼荼羅
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